Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.195e-8■■■■■ 31.4
RPS3P23396 TUBA1C-209ENST00000552448 1800 ntTSL 310.63□□□□□ -0.715e-8■■■■■ 31.4
RPS3P23396 TUBA1C-202ENST00000541364 1695 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.85e-8■■■■■ 31.4
RPS3P23396 TUBA1C-210ENST00000639419 1075 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.925e-8■■■■■ 31.4
RPS3P23396 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.794e-8■■■■■ 31.3
RPS3P23396 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.784e-8■■■■■ 31.3
RPS3P23396 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.724e-8■■■■■ 31.3
RPS3P23396 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.64e-8■■■■■ 31.3
RPS3P23396 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.44e-8■■■■■ 31.3
RPS3P23396 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.394e-8■■■■■ 31.3
RPS3P23396 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.244e-8■■■■■ 31.3
RPS3P23396 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.224e-8■■■■■ 31.3
RPS3P23396 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.224e-8■■■■■ 31.3
RPS3P23396 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 31.3
RPS3P23396 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.034e-8■■■■■ 31.3
RPS3P23396 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 31.3
RPS3P23396 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.454e-8■■■■■ 31.3
RPS3P23396 ANAPC11-205ENST00000571570 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.854e-8■■■■■ 31.3
RPS3P23396 ANXA2-223ENST00000559647 484 ntTSL 28.81□□□□□ -14e-10■■■■■ 31.3
RPS3P23396 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 31.3
RPS3P23396 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 31.3
RPS3P23396 FARSA-206ENST00000587981 521 ntTSL 217.39■□□□□ 0.379e-7■■■■■ 31.3
RPS3P23396 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 OAT-204ENST00000476917 646 ntTSL 30.73□□□□□ -2.291e-6■■■■■ 31.2
RPS3P23396 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.9■■■□□ 2.064e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.067e-13■■■■■ 31.2
RPS3P23396 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.497e-13■■■■■ 31.2
RPS3P23396 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.377e-13■■■■■ 31.2
RPS3P23396 DYNLL1-206ENST00000549649 794 ntTSL 317.39■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.077e-13■■■■■ 31.2
RPS3P23396 DYNLL1-211ENST00000552870 595 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.597e-13■■■■■ 31.2
RPS3P23396 DYNLL1-202ENST00000392508 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.957e-13■■■■■ 31.2
RPS3P23396 NDUFA5-205ENST00000467117 687 ntTSL 212.72□□□□□ -0.375e-8■■■■■ 31.2
RPS3P23396 NDUFA5-211ENST00000611607 1504 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.435e-8■■■■■ 31.2
RPS3P23396 NDUFA5-212ENST00000618945 1432 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.455e-8■■■■■ 31.2
RPS3P23396 NDUFA5-201ENST00000355749 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.515e-8■■■■■ 31.2
RPS3P23396 NDUFA5-204ENST00000466896 778 ntTSL 310.07□□□□□ -0.85e-8■■■■■ 31.2
RPS3P23396 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.565e-8■■■■■ 31.2
RPS3P23396 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 31.2
RPS3P23396 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 31.2
RPS3P23396 MRPL39-203ENST00000419219 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.38■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 31.2
RPS3P23396 CKB-207ENST00000554282 735 ntTSL 219.9■□□□□ 0.781e-8■■■■■ 31.2
RPS3P23396 CKB-202ENST00000553528 1170 ntTSL 216.6■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 31.2
RPS3P23396 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 31.2
RPS3P23396 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-12■■■■■ 31.2
RPS3P23396 ZNHIT1-203ENST00000485387 2898 ntTSL 1 (best)13.23□□□□□ -0.291e-12■■■■■ 31.2
RPS3P23396 ECH1-215ENST00000601333 710 ntTSL 214.4□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 31.1
RPS3P23396 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.557e-14■■■■■ 31.1
RPS3P23396 EIF4A1-205ENST00000577738 531 ntTSL 212.66□□□□□ -0.382e-12■■■■■ 31.1
RPS3P23396 GANAB-203ENST00000524437 671 ntTSL 218.46■□□□□ 0.556e-10■■■■■ 31.1
RPS3P23396 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.463e-9■■■■■ 31.1
RPS3P23396 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.133e-9■■■■■ 31.1
RPS3P23396 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.823e-9■■■■■ 31.1
RPS3P23396 SLIRP-207ENST00000556831 729 ntTSL 213.72□□□□□ -0.215e-12■■■■■ 31
RPS3P23396 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.634e-10■■■■■ 31
RPS3P23396 CCAR2-205ENST00000520738 2633 ntTSL 215.64■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 31
RPS3P23396 HPRT1-202ENST00000462974 724 ntTSL 315.56■□□□□ 0.087e-8■■■■■ 31
RPS3P23396 HP-213ENST00000567612 1232 ntTSL 59.45□□□□□ -0.93e-7■■■■■ 31
RPS3P23396 HP-212ENST00000567185 1251 ntTSL 58.71□□□□□ -1.023e-7■■■■■ 31
RPS3P23396 GALK1-203ENST00000586733 465 ntTSL 217.56■□□□□ 0.41e-10■■■■■ 31
RPS3P23396 GALK1-207ENST00000589643 313 ntTSL 314.23□□□□□ -0.131e-10■■■■■ 31
RPS3P23396 C14orf2-208ENST00000554713 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.571e-10■■■■■ 31
RPS3P23396 PSMD2-211ENST00000466987 530 ntTSL 210.4□□□□□ -0.741e-10■■■■■ 31
RPS3P23396 C14orf2-212ENST00000557260 856 ntTSL 1 (best)9.87□□□□□ -0.831e-10■■■■■ 31
RPS3P23396 PSMD2-209ENST00000460628 565 ntTSL 28.98□□□□□ -0.971e-10■■■■■ 31
RPS3P23396 PSMD2-217ENST00000491149 895 ntTSL 28.67□□□□□ -1.021e-10■■■■■ 31
RPS3P23396 C14orf2-207ENST00000554528 526 ntTSL 27.51□□□□□ -1.211e-10■■■■■ 31
RPS3P23396 C14orf2-205ENST00000554089 932 ntTSL 1 (best)7.1□□□□□ -1.271e-10■■■■■ 31
RPS3P23396 VSNL1-205ENST00000457525 576 ntTSL 34.96□□□□□ -1.621e-10■■■■■ 31
RPS3P23396 PSMD10-201ENST00000217958 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 31
RPS3P23396 PSMD10-205ENST00000372295 779 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 31
RPS3P23396 PSMD10-203ENST00000340200 713 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.194e-7■■■■■ 31
RPS3P23396 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.424e-7■■■■■ 31
RPS3P23396 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 31
RPS3P23396 PSMD10-207ENST00000553388 1039 ntTSL 1 (best)4.65□□□□□ -1.674e-7■■■■■ 31
RPS3P23396 HYOU1-214ENST00000534233 711 ntTSL 219.08■□□□□ 0.647e-12■■■■■ 31
RPS3P23396 HYOU1-210ENST00000531968 550 ntTSL 413.13□□□□□ -0.317e-12■■■■■ 31
RPS3P23396 ANXA1-207ENST00000491192 1400 ntTSL 1 (best)4.39□□□□□ -1.717e-7■■■■■ 31
RPS3P23396 MYL6-205ENST00000546845 452 ntTSL 38.75□□□□□ -1.013e-12■■■■■ 31
RPS3P23396 BUD23-202ENST00000421304 538 ntTSL 418.12■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 31
RPS3P23396 COX6C-202ENST00000517682 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.892e-13■■■■■ 30.9
RPS3P23396 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.972e-13■■■■■ 30.9
RPS3P23396 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.382e-13■■■■■ 30.9
RPS3P23396 COX6C-206ENST00000520517 566 ntTSL 45.39□□□□□ -1.552e-13■■■■■ 30.9
RPS3P23396 COX6C-207ENST00000522934 562 ntTSL 44.72□□□□□ -1.652e-13■■■■■ 30.9
RPS3P23396 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 DDX56-208ENST00000467318 1665 ntTSL 514.55□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 DDX56-205ENST00000433257 1682 ntTSL 514.45□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 30.9
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