Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR4P22455 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms