Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB4P21439 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB4P21439 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms