Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMNB1P20700 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms