Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms