Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR2EP19388 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms