Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT15P19012 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT15P19012 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT15P19012 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT15P19012 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT15P19012 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT15P19012 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT15P19012 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT15P19012 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT15P19012 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT15P19012 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT15P19012 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT15P19012 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT15P19012 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT15P19012 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT15P19012 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT15P19012 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT15P19012 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT15P19012 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT15P19012 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT15P19012 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT15P19012 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT15P19012 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT15P19012 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT15P19012 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT15P19012 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT15P19012 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT15P19012 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT15P19012 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT15P19012 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT15P19012 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT15P19012 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT15P19012 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT15P19012 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT15P19012 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT15P19012 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT15P19012 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT15P19012 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT15P19012 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT15P19012 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT15P19012 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT15P19012 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT15P19012 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT15P19012 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT15P19012 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT15P19012 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT15P19012 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT15P19012 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT15P19012 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT15P19012 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT15P19012 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT15P19012 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT15P19012 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT15P19012 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT15P19012 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT15P19012 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT15P19012 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT15P19012 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT15P19012 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT15P19012 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT15P19012 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT15P19012 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT15P19012 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT15P19012 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT15P19012 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT15P19012 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT15P19012 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT15P19012 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT15P19012 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT15P19012 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT15P19012 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT15P19012 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT15P19012 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT15P19012 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT15P19012 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT15P19012 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT15P19012 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT15P19012 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT15P19012 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT15P19012 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT15P19012 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT15P19012 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT15P19012 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT15P19012 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT15P19012 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT15P19012 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT15P19012 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT15P19012 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT15P19012 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT15P19012 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT15P19012 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT15P19012 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT15P19012 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT15P19012 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT15P19012 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT15P19012 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT15P19012 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT15P19012 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT15P19012 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT15P19012 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms