Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCC1P18754 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCC1P18754 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RCC1P18754 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCC1P18754 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCC1P18754 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCC1P18754 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCC1P18754 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCC1P18754 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCC1P18754 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCC1P18754 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCC1P18754 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCC1P18754 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCC1P18754 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCC1P18754 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCC1P18754 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCC1P18754 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCC1P18754 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCC1P18754 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCC1P18754 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCC1P18754 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCC1P18754 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCC1P18754 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCC1P18754 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCC1P18754 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCC1P18754 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCC1P18754 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCC1P18754 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCC1P18754 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCC1P18754 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCC1P18754 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RCC1P18754 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RCC1P18754 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RCC1P18754 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCC1P18754 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCC1P18754 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCC1P18754 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCC1P18754 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCC1P18754 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCC1P18754 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCC1P18754 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms