Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DESP17661 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DESP17661 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DESP17661 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DESP17661 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DESP17661 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DESP17661 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DESP17661 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DESP17661 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DESP17661 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DESP17661 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DESP17661 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DESP17661 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DESP17661 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DESP17661 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DESP17661 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DESP17661 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DESP17661 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DESP17661 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DESP17661 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DESP17661 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DESP17661 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DESP17661 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DESP17661 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DESP17661 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DESP17661 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DESP17661 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DESP17661 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DESP17661 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DESP17661 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DESP17661 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DESP17661 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DESP17661 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DESP17661 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DESP17661 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DESP17661 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DESP17661 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DESP17661 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DESP17661 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DESP17661 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DESP17661 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DESP17661 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DESP17661 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DESP17661 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DESP17661 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DESP17661 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DESP17661 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DESP17661 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DESP17661 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DESP17661 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DESP17661 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DESP17661 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DESP17661 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DESP17661 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DESP17661 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DESP17661 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DESP17661 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DESP17661 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DESP17661 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DESP17661 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DESP17661 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DESP17661 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DESP17661 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DESP17661 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DESP17661 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DESP17661 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DESP17661 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DESP17661 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DESP17661 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DESP17661 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DESP17661 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DESP17661 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DESP17661 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DESP17661 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DESP17661 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DESP17661 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DESP17661 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DESP17661 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DESP17661 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DESP17661 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DESP17661 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DESP17661 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DESP17661 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DESP17661 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DESP17661 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DESP17661 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DESP17661 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DESP17661 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DESP17661 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DESP17661 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DESP17661 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DESP17661 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DESP17661 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DESP17661 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DESP17661 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DESP17661 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DESP17661 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms