Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYN1P17600 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYN1P17600 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYN1P17600 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYN1P17600 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYN1P17600 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYN1P17600 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYN1P17600 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYN1P17600 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYN1P17600 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYN1P17600 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYN1P17600 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYN1P17600 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYN1P17600 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYN1P17600 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYN1P17600 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYN1P17600 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYN1P17600 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYN1P17600 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYN1P17600 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYN1P17600 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYN1P17600 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYN1P17600 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYN1P17600 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYN1P17600 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYN1P17600 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYN1P17600 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYN1P17600 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYN1P17600 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYN1P17600 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYN1P17600 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYN1P17600 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYN1P17600 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYN1P17600 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYN1P17600 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYN1P17600 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYN1P17600 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYN1P17600 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYN1P17600 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYN1P17600 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYN1P17600 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYN1P17600 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYN1P17600 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYN1P17600 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYN1P17600 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYN1P17600 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYN1P17600 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYN1P17600 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYN1P17600 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYN1P17600 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYN1P17600 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYN1P17600 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYN1P17600 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYN1P17600 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYN1P17600 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYN1P17600 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYN1P17600 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYN1P17600 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYN1P17600 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYN1P17600 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYN1P17600 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYN1P17600 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYN1P17600 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYN1P17600 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYN1P17600 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYN1P17600 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYN1P17600 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYN1P17600 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYN1P17600 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYN1P17600 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYN1P17600 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYN1P17600 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYN1P17600 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYN1P17600 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYN1P17600 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYN1P17600 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYN1P17600 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYN1P17600 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYN1P17600 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYN1P17600 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYN1P17600 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYN1P17600 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYN1P17600 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYN1P17600 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYN1P17600 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYN1P17600 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms