Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRAP16234 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms