Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF4P15884 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF4P15884 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF4P15884 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF4P15884 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF4P15884 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF4P15884 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF4P15884 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF4P15884 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF4P15884 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF4P15884 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF4P15884 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF4P15884 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF4P15884 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF4P15884 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF4P15884 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF4P15884 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF4P15884 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF4P15884 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF4P15884 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF4P15884 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF4P15884 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF4P15884 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF4P15884 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF4P15884 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF4P15884 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF4P15884 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF4P15884 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF4P15884 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF4P15884 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF4P15884 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF4P15884 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF4P15884 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF4P15884 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF4P15884 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF4P15884 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF4P15884 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms