Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEACAM1P13688 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEACAM1P13688 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM1P13688 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM1P13688 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM1P13688 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM1P13688 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM1P13688 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM1P13688 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM1P13688 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM1P13688 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM1P13688 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM1P13688 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM1P13688 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM1P13688 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM1P13688 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM1P13688 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM1P13688 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM1P13688 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM1P13688 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM1P13688 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM1P13688 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM1P13688 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM1P13688 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM1P13688 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM1P13688 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM1P13688 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM1P13688 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM1P13688 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM1P13688 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM1P13688 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM1P13688 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM1P13688 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM1P13688 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM1P13688 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM1P13688 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM1P13688 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM1P13688 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM1P13688 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM1P13688 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM1P13688 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM1P13688 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM1P13688 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM1P13688 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM1P13688 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM1P13688 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM1P13688 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM1P13688 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM1P13688 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM1P13688 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM1P13688 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM1P13688 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms