Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL5P13501 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL5P13501 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL5P13501 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL5P13501 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL5P13501 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL5P13501 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL5P13501 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL5P13501 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL5P13501 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL5P13501 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL5P13501 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL5P13501 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL5P13501 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL5P13501 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL5P13501 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL5P13501 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL5P13501 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL5P13501 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL5P13501 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL5P13501 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCL5P13501 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCL5P13501 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCL5P13501 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCL5P13501 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL5P13501 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL5P13501 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL5P13501 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL5P13501 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL5P13501 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL5P13501 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL5P13501 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL5P13501 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL5P13501 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL5P13501 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL5P13501 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL5P13501 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL5P13501 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL5P13501 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL5P13501 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL5P13501 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL5P13501 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL5P13501 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL5P13501 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL5P13501 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL5P13501 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL5P13501 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL5P13501 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL5P13501 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL5P13501 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL5P13501 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL5P13501 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL5P13501 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL5P13501 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL5P13501 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL5P13501 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL5P13501 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL5P13501 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL5P13501 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL5P13501 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL5P13501 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL5P13501 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL5P13501 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL5P13501 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL5P13501 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL5P13501 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL5P13501 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL5P13501 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL5P13501 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL5P13501 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL5P13501 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL5P13501 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL5P13501 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL5P13501 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL5P13501 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL5P13501 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL5P13501 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL5P13501 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL5P13501 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL5P13501 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL5P13501 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL5P13501 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL5P13501 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL5P13501 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL5P13501 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCL5P13501 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCL5P13501 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms