Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR2F1P10589 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms