Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMIGD3P0DMS9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms