Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSH2P0DML3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSH2P0DML3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms