Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms