Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPRAP08240 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms