Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NGFRP08138 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NGFRP08138 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NGFRP08138 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NGFRP08138 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NGFRP08138 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NGFRP08138 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NGFRP08138 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NGFRP08138 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NGFRP08138 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NGFRP08138 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NGFRP08138 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NGFRP08138 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NGFRP08138 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NGFRP08138 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NGFRP08138 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NGFRP08138 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NGFRP08138 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NGFRP08138 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NGFRP08138 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NGFRP08138 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NGFRP08138 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NGFRP08138 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NGFRP08138 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NGFRP08138 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NGFRP08138 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NGFRP08138 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NGFRP08138 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NGFRP08138 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NGFRP08138 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NGFRP08138 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NGFRP08138 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NGFRP08138 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NGFRP08138 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NGFRP08138 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NGFRP08138 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NGFRP08138 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NGFRP08138 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NGFRP08138 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NGFRP08138 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NGFRP08138 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NGFRP08138 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NGFRP08138 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NGFRP08138 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NGFRP08138 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NGFRP08138 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NGFRP08138 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NGFRP08138 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NGFRP08138 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NGFRP08138 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NGFRP08138 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NGFRP08138 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NGFRP08138 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NGFRP08138 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NGFRP08138 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NGFRP08138 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NGFRP08138 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NGFRP08138 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NGFRP08138 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NGFRP08138 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NGFRP08138 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NGFRP08138 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NGFRP08138 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NGFRP08138 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NGFRP08138 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NGFRP08138 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NGFRP08138 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NGFRP08138 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NGFRP08138 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms