Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM2P07951 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM2P07951 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM2P07951 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPM2P07951 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPM2P07951 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TPM2P07951 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TPM2P07951 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPM2P07951 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPM2P07951 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TPM2P07951 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPM2P07951 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM2P07951 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM2P07951 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM2P07951 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM2P07951 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM2P07951 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM2P07951 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM2P07951 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM2P07951 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM2P07951 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM2P07951 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM2P07951 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM2P07951 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM2P07951 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM2P07951 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM2P07951 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM2P07951 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM2P07951 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM2P07951 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM2P07951 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM2P07951 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM2P07951 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM2P07951 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM2P07951 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM2P07951 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM2P07951 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM2P07951 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM2P07951 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM2P07951 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM2P07951 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM2P07951 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM2P07951 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM2P07951 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM2P07951 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM2P07951 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM2P07951 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM2P07951 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM2P07951 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM2P07951 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM2P07951 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM2P07951 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM2P07951 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM2P07951 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM2P07951 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM2P07951 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPM2P07951 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPM2P07951 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPM2P07951 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPM2P07951 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPM2P07951 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPM2P07951 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPM2P07951 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPM2P07951 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPM2P07951 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPM2P07951 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPM2P07951 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPM2P07951 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPM2P07951 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM2P07951 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM2P07951 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM2P07951 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM2P07951 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM2P07951 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM2P07951 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM2P07951 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM2P07951 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM2P07951 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM2P07951 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM2P07951 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM2P07951 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM2P07951 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM2P07951 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM2P07951 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM2P07951 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM2P07951 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM2P07951 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM2P07951 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM2P07951 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM2P07951 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM2P07951 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM2P07951 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM2P07951 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM2P07951 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM2P07951 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM2P07951 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM2P07951 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM2P07951 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM2P07951 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms