Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA4P06727 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA4P06727 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA4P06727 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA4P06727 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA4P06727 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA4P06727 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA4P06727 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA4P06727 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA4P06727 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA4P06727 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA4P06727 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA4P06727 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA4P06727 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA4P06727 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA4P06727 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA4P06727 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA4P06727 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA4P06727 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA4P06727 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA4P06727 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA4P06727 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA4P06727 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA4P06727 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA4P06727 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA4P06727 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA4P06727 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA4P06727 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA4P06727 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA4P06727 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA4P06727 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA4P06727 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA4P06727 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA4P06727 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA4P06727 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA4P06727 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA4P06727 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA4P06727 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA4P06727 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA4P06727 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA4P06727 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOA4P06727 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOA4P06727 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOA4P06727 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOA4P06727 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA4P06727 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA4P06727 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA4P06727 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA4P06727 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA4P06727 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA4P06727 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA4P06727 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA4P06727 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA4P06727 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA4P06727 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA4P06727 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA4P06727 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA4P06727 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA4P06727 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOA4P06727 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA4P06727 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA4P06727 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA4P06727 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA4P06727 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms