Protein–RNA interactions for Protein: P05538

HLA-DQB2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB2P05538 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB2P05538 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms