Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL10P02778 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms