Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAP4K4O95819 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP4K4O95819 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP4K4O95819 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP4K4O95819 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP4K4O95819 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP4K4O95819 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP4K4O95819 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP4K4O95819 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP4K4O95819 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP4K4O95819 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP4K4O95819 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP4K4O95819 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms