Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UFL1O94874 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UFL1O94874 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UFL1O94874 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UFL1O94874 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UFL1O94874 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UFL1O94874 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UFL1O94874 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UFL1O94874 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UFL1O94874 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UFL1O94874 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UFL1O94874 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UFL1O94874 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UFL1O94874 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UFL1O94874 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UFL1O94874 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UFL1O94874 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UFL1O94874 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UFL1O94874 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UFL1O94874 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UFL1O94874 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UFL1O94874 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UFL1O94874 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UFL1O94874 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UFL1O94874 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UFL1O94874 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UFL1O94874 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UFL1O94874 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UFL1O94874 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UFL1O94874 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UFL1O94874 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UFL1O94874 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UFL1O94874 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UFL1O94874 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UFL1O94874 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UFL1O94874 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UFL1O94874 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UFL1O94874 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UFL1O94874 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UFL1O94874 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UFL1O94874 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UFL1O94874 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UFL1O94874 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UFL1O94874 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UFL1O94874 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UFL1O94874 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UFL1O94874 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UFL1O94874 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UFL1O94874 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UFL1O94874 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UFL1O94874 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UFL1O94874 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UFL1O94874 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UFL1O94874 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UFL1O94874 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
UFL1O94874 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UFL1O94874 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UFL1O94874 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UFL1O94874 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UFL1O94874 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UFL1O94874 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UFL1O94874 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UFL1O94874 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UFL1O94874 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
UFL1O94874 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
UFL1O94874 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UFL1O94874 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UFL1O94874 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UFL1O94874 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UFL1O94874 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UFL1O94874 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UFL1O94874 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms