Protein–RNA interactions for Protein: O75969

AKAP3, A-kinase anchor protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP3O75969 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AKAP3O75969 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AKAP3O75969 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms