Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms