Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC44.74■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC44.74■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC44.73■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC44.72■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
ABCC9O60706 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC44.67■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC44.67■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.74
ABCC9O60706 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
ABCC9O60706 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC44.62■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms