Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA5O60264 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms