Protein–RNA interactions for Protein: O43934

MFSD11, UNC93-like protein MFSD11, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD11O43934 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD11O43934 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD11O43934 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD11O43934 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms