Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3O43889 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3O43889 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3O43889 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3O43889 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3O43889 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3O43889 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3O43889 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3O43889 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3O43889 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3O43889 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3O43889 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3O43889 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3O43889 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3O43889 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3O43889 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3O43889 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3O43889 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3O43889 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3O43889 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3O43889 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3O43889 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3O43889 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3O43889 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3O43889 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3O43889 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3O43889 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3O43889 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3O43889 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3O43889 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3O43889 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3O43889 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3O43889 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3O43889 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3O43889 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3O43889 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3O43889 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3O43889 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3O43889 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3O43889 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3O43889 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3O43889 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3O43889 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3O43889 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CREB3O43889 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CREB3O43889 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3O43889 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3O43889 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3O43889 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3O43889 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3O43889 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3O43889 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3O43889 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3O43889 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3O43889 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3O43889 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3O43889 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3O43889 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3O43889 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3O43889 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3O43889 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3O43889 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3O43889 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3O43889 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3O43889 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3O43889 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3O43889 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3O43889 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3O43889 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3O43889 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3O43889 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3O43889 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3O43889 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3O43889 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3O43889 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3O43889 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3O43889 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3O43889 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3O43889 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3O43889 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms