Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP9BO43861 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms