Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BUD23O43709 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BUD23O43709 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BUD23O43709 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BUD23O43709 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BUD23O43709 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BUD23O43709 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BUD23O43709 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BUD23O43709 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BUD23O43709 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BUD23O43709 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BUD23O43709 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BUD23O43709 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BUD23O43709 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BUD23O43709 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BUD23O43709 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BUD23O43709 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BUD23O43709 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BUD23O43709 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BUD23O43709 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BUD23O43709 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BUD23O43709 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BUD23O43709 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BUD23O43709 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BUD23O43709 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BUD23O43709 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BUD23O43709 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BUD23O43709 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BUD23O43709 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BUD23O43709 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BUD23O43709 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BUD23O43709 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BUD23O43709 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BUD23O43709 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BUD23O43709 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BUD23O43709 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BUD23O43709 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BUD23O43709 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BUD23O43709 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BUD23O43709 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BUD23O43709 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BUD23O43709 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BUD23O43709 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BUD23O43709 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BUD23O43709 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BUD23O43709 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BUD23O43709 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BUD23O43709 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BUD23O43709 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BUD23O43709 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BUD23O43709 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BUD23O43709 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BUD23O43709 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BUD23O43709 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BUD23O43709 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BUD23O43709 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BUD23O43709 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BUD23O43709 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BUD23O43709 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BUD23O43709 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BUD23O43709 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BUD23O43709 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BUD23O43709 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BUD23O43709 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BUD23O43709 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms