Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNFSF14O43557 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms