Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms