Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTIFO43310 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTIFO43310 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTIFO43310 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTIFO43310 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTIFO43310 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTIFO43310 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTIFO43310 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTIFO43310 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTIFO43310 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTIFO43310 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTIFO43310 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTIFO43310 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTIFO43310 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTIFO43310 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTIFO43310 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTIFO43310 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTIFO43310 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTIFO43310 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTIFO43310 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTIFO43310 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTIFO43310 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTIFO43310 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTIFO43310 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTIFO43310 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTIFO43310 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTIFO43310 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTIFO43310 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTIFO43310 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTIFO43310 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTIFO43310 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTIFO43310 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTIFO43310 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTIFO43310 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTIFO43310 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTIFO43310 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTIFO43310 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTIFO43310 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTIFO43310 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTIFO43310 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTIFO43310 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTIFO43310 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTIFO43310 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTIFO43310 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTIFO43310 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTIFO43310 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTIFO43310 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTIFO43310 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTIFO43310 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTIFO43310 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTIFO43310 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTIFO43310 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTIFO43310 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTIFO43310 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTIFO43310 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTIFO43310 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTIFO43310 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTIFO43310 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTIFO43310 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTIFO43310 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTIFO43310 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTIFO43310 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTIFO43310 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTIFO43310 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTIFO43310 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTIFO43310 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTIFO43310 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTIFO43310 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTIFO43310 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTIFO43310 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTIFO43310 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTIFO43310 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTIFO43310 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTIFO43310 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTIFO43310 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTIFO43310 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTIFO43310 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTIFO43310 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTIFO43310 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTIFO43310 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTIFO43310 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTIFO43310 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTIFO43310 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTIFO43310 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTIFO43310 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTIFO43310 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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