Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAA1O43292 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPAA1O43292 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms