Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26A1O43174 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms