Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2DO15399 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms