Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHADO15335 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHADO15335 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHADO15335 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHADO15335 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHADO15335 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHADO15335 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHADO15335 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHADO15335 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHADO15335 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHADO15335 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHADO15335 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHADO15335 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHADO15335 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHADO15335 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHADO15335 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHADO15335 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHADO15335 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHADO15335 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHADO15335 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHADO15335 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHADO15335 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHADO15335 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHADO15335 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHADO15335 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHADO15335 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHADO15335 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHADO15335 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHADO15335 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHADO15335 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHADO15335 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHADO15335 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHADO15335 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHADO15335 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHADO15335 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHADO15335 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHADO15335 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHADO15335 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHADO15335 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHADO15335 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHADO15335 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHADO15335 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHADO15335 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHADO15335 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHADO15335 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHADO15335 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHADO15335 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHADO15335 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHADO15335 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHADO15335 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHADO15335 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHADO15335 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHADO15335 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHADO15335 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHADO15335 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHADO15335 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHADO15335 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHADO15335 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHADO15335 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHADO15335 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHADO15335 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHADO15335 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHADO15335 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHADO15335 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHADO15335 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHADO15335 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHADO15335 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHADO15335 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHADO15335 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHADO15335 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHADO15335 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHADO15335 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHADO15335 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms