Protein–RNA interactions for Protein: O15321

TM9SF1, Transmembrane 9 superfamily member 1, humanhuman

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF1O15321 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TM9SF1O15321 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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TM9SF1O15321 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM9SF1O15321 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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