Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN3O15232 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN3O15232 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN3O15232 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN3O15232 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN3O15232 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN3O15232 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN3O15232 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN3O15232 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN3O15232 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN3O15232 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN3O15232 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN3O15232 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN3O15232 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN3O15232 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN3O15232 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN3O15232 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN3O15232 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN3O15232 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN3O15232 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN3O15232 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN3O15232 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN3O15232 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN3O15232 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN3O15232 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN3O15232 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN3O15232 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN3O15232 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN3O15232 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN3O15232 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN3O15232 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN3O15232 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN3O15232 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN3O15232 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN3O15232 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN3O15232 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MATN3O15232 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN3O15232 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN3O15232 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN3O15232 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN3O15232 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN3O15232 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN3O15232 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN3O15232 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN3O15232 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN3O15232 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN3O15232 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN3O15232 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN3O15232 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN3O15232 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN3O15232 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN3O15232 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN3O15232 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN3O15232 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN3O15232 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN3O15232 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN3O15232 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN3O15232 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN3O15232 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN3O15232 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN3O15232 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN3O15232 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN3O15232 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN3O15232 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN3O15232 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN3O15232 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN3O15232 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms