Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHUKO15111 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHUKO15111 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHUKO15111 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHUKO15111 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHUKO15111 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHUKO15111 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHUKO15111 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHUKO15111 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHUKO15111 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHUKO15111 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHUKO15111 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHUKO15111 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHUKO15111 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHUKO15111 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHUKO15111 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHUKO15111 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHUKO15111 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHUKO15111 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHUKO15111 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHUKO15111 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHUKO15111 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHUKO15111 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHUKO15111 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHUKO15111 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHUKO15111 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHUKO15111 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHUKO15111 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHUKO15111 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHUKO15111 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHUKO15111 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHUKO15111 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHUKO15111 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHUKO15111 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms