Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLGNO14967 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLGNO14967 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLGNO14967 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLGNO14967 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLGNO14967 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLGNO14967 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLGNO14967 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLGNO14967 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLGNO14967 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLGNO14967 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLGNO14967 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLGNO14967 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLGNO14967 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLGNO14967 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLGNO14967 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLGNO14967 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLGNO14967 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLGNO14967 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLGNO14967 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLGNO14967 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLGNO14967 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLGNO14967 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLGNO14967 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLGNO14967 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLGNO14967 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLGNO14967 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLGNO14967 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLGNO14967 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLGNO14967 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CLGNO14967 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLGNO14967 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLGNO14967 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLGNO14967 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLGNO14967 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLGNO14967 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLGNO14967 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLGNO14967 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLGNO14967 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLGNO14967 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLGNO14967 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLGNO14967 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLGNO14967 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLGNO14967 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLGNO14967 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLGNO14967 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLGNO14967 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLGNO14967 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLGNO14967 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLGNO14967 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLGNO14967 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLGNO14967 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLGNO14967 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLGNO14967 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLGNO14967 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLGNO14967 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLGNO14967 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLGNO14967 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLGNO14967 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLGNO14967 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLGNO14967 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLGNO14967 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLGNO14967 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLGNO14967 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLGNO14967 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLGNO14967 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLGNO14967 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLGNO14967 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLGNO14967 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLGNO14967 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLGNO14967 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLGNO14967 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLGNO14967 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLGNO14967 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLGNO14967 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLGNO14967 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLGNO14967 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLGNO14967 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLGNO14967 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLGNO14967 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLGNO14967 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLGNO14967 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLGNO14967 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLGNO14967 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLGNO14967 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLGNO14967 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLGNO14967 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLGNO14967 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLGNO14967 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLGNO14967 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLGNO14967 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLGNO14967 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLGNO14967 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms