Protein–RNA interactions for Protein: O14965

AURKA, Aurora kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKAO14965 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AURKAO14965 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AURKAO14965 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AURKAO14965 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AURKAO14965 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AURKAO14965 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AURKAO14965 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AURKAO14965 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AURKAO14965 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AURKAO14965 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AURKAO14965 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AURKAO14965 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AURKAO14965 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AURKAO14965 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AURKAO14965 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AURKAO14965 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AURKAO14965 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AURKAO14965 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AURKAO14965 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AURKAO14965 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AURKAO14965 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AURKAO14965 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AURKAO14965 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AURKAO14965 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AURKAO14965 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AURKAO14965 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AURKAO14965 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AURKAO14965 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AURKAO14965 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AURKAO14965 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AURKAO14965 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AURKAO14965 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AURKAO14965 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AURKAO14965 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AURKAO14965 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AURKAO14965 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AURKAO14965 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AURKAO14965 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AURKAO14965 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AURKAO14965 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AURKAO14965 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AURKAO14965 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AURKAO14965 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AURKAO14965 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AURKAO14965 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AURKAO14965 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AURKAO14965 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AURKAO14965 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AURKAO14965 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AURKAO14965 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AURKAO14965 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AURKAO14965 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AURKAO14965 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AURKAO14965 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AURKAO14965 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms