Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHOX2AO14813 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms