Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F3O00716 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F3O00716 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F3O00716 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F3O00716 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F3O00716 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F3O00716 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F3O00716 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F3O00716 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F3O00716 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F3O00716 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F3O00716 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F3O00716 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F3O00716 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F3O00716 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F3O00716 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F3O00716 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F3O00716 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F3O00716 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F3O00716 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F3O00716 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F3O00716 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F3O00716 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F3O00716 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F3O00716 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F3O00716 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2F3O00716 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F3O00716 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F3O00716 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F3O00716 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F3O00716 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F3O00716 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F3O00716 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F3O00716 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F3O00716 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F3O00716 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F3O00716 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F3O00716 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F3O00716 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F3O00716 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F3O00716 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F3O00716 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F3O00716 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F3O00716 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F3O00716 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F3O00716 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F3O00716 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F3O00716 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F3O00716 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F3O00716 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F3O00716 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F3O00716 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F3O00716 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F3O00716 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F3O00716 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F3O00716 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F3O00716 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F3O00716 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F3O00716 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F3O00716 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F3O00716 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F3O00716 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms