Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 EPB41L1-205ENST00000373946 6327 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.595e-13■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 EPB41L1-208ENST00000427533 460 ntTSL 39.93□□□□□ -0.825e-13■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 EPB41L1-201ENST00000202028 3514 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.945e-13■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.643e-7■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 ADIPOR1-204ENST00000426229 879 ntTSL 215.57■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 ADIPOR1-203ENST00000417068 1058 ntTSL 314.6□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 RAP2C-204ENST00000490400 215 ntTSL 217.29■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 LAPTM4B-202ENST00000517924 618 ntTSL 525.19■■□□□ 1.623e-11■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.064e-19■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 IER3IP1-201ENST00000256433 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.394e-19■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 TBL2-206ENST00000433464 1423 ntTSL 228.23■■■□□ 2.112e-18■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 TBL2-221ENST00000496056 579 ntTSL 226.37■■□□□ 1.812e-18■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 TBL2-211ENST00000452475 1262 ntTSL 326.37■■□□□ 1.812e-18■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 TBL2-207ENST00000435792 1109 ntTSL 326.19■■□□□ 1.782e-18■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 TBL2-203ENST00000424598 2276 ntTSL 226.02■■□□□ 1.762e-18■■■■■ 41.5
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DDX3XO00571 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.682e-18■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 TBL2-204ENST00000426966 1196 ntTSL 324.5■■□□□ 1.512e-18■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 TBL2-209ENST00000450285 2209 ntTSL 1 (best)23.83■■□□□ 1.412e-18■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 TBL2-202ENST00000417008 1717 ntTSL 519.39■□□□□ 0.72e-18■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.572e-18■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 TBL2-218ENST00000479892 494 ntTSL 46.92□□□□□ -1.32e-18■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.444e-11■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.474e-11■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.554e-11■■■■■ 41.5
DDX3XO00571 PDCD2L-204ENST00000587385 1227 ntTSL 527.57■■■□□ 21e-17■■■■■ 41.4
DDX3XO00571 AC092073.1-201ENST00000592740 625 ntAPPRIS P1 TSL 318.03■□□□□ 0.481e-17■■■■■ 41.4
DDX3XO00571 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.241e-17■■■■■ 41.4
DDX3XO00571 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.31e-17■■■■■ 41.4
DDX3XO00571 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.189e-14■■■■■ 41.4
DDX3XO00571 TMEM64-202ENST00000422900 1174 ntTSL 215.27■□□□□ 0.047e-8■■■■■ 41.4
DDX3XO00571 MS4A3-206ENST00000528298 486 ntTSL 311.98□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 TNFRSF12A-207ENST00000575836 161 ntTSL 316.01■□□□□ 0.152e-41■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 DNAJA2-201ENST00000317089 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.541e-25■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 DNAJA2-202ENST00000563158 1825 ntTSL 511.11□□□□□ -0.631e-25■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.522e-51■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 CD63-211ENST00000551173 788 ntTSL 318.27■□□□□ 0.522e-51■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.052e-51■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 CD63-215ENST00000552754 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-51■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.933e-11■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 CSF1-202ENST00000357302 597 ntTSL 320.71■□□□□ 0.913e-11■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.833e-11■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.573e-11■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 CSF1-206ENST00000488198 1009 ntTSL 318.33■□□□□ 0.523e-11■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.133e-11■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 CSF1-207ENST00000525659 551 ntTSL 415.35■□□□□ 0.053e-11■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 AC104117.3-201ENST00000519491 674 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 CSF1-209ENST00000527192 577 ntTSL 47.55□□□□□ -1.23e-11■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 IBTK-202ENST00000369751 4437 ntTSL 1 (best)8.01□□□□□ -1.137e-10■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.227e-10■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.337e-10■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 IBTK-205ENST00000503400 5239 ntTSL 1 (best)6.46□□□□□ -1.377e-10■■■■■ 41.3
DDX3XO00571 NFE2L1-209ENST00000579889 568 ntTSL 313.81□□□□□ -0.22e-10■■■■■ 41.2
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DDX3XO00571 ALDOC-206ENST00000578590 839 ntTSL 411.35□□□□□ -0.593e-16■■■■■ 41.2
DDX3XO00571 ALDOC-204ENST00000435638 579 ntTSL 310.19□□□□□ -0.783e-16■■■■■ 41.2
DDX3XO00571 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.246e-13■■■■■ 41.2
DDX3XO00571 SLC47A1-208ENST00000574596 1755 nt22.1■■□□□ 1.133e-21■■■■■ 41.2
DDX3XO00571 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.059e-40■■■■■ 41.2
DDX3XO00571 ODC1-203ENST00000443218 494 ntTSL 216.07■□□□□ 0.169e-40■■■■■ 41.2
DDX3XO00571 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.941e-9■■■■■ 41.2
DDX3XO00571 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-9■■■■■ 41.2
DDX3XO00571 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.221e-9■■■■■ 41.2
DDX3XO00571 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.14e-24■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.884e-24■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 COX20-205ENST00000498262 2290 ntTSL 218.85■□□□□ 0.614e-24■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 COX20-202ENST00000391839 1005 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.114e-24■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.888e-8■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 C8orf76-206ENST00000522477 491 ntTSL 419.01■□□□□ 0.631e-15■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 C8orf76-207ENST00000523726 702 ntTSL 218.68■□□□□ 0.581e-15■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.531e-15■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.261e-15■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 SDHC-209ENST00000515731 651 ntTSL 315.97■□□□□ 0.158e-8■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 C8orf76-205ENST00000521310 948 ntTSL 313.98□□□□□ -0.171e-15■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 C8orf76-204ENST00000519791 569 ntTSL 213.49□□□□□ -0.251e-15■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 SDHC-208ENST00000513009 369 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.068e-8■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.238e-8■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 SDHC-207ENST00000504963 571 ntTSL 47.16□□□□□ -1.268e-8■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.318e-8■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.598e-8■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.635e-13■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.055e-13■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 UXS1-214ENST00000483426 541 ntTSL 418.77■□□□□ 0.65e-13■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 UXS1-206ENST00000441952 570 ntTSL 218.77■□□□□ 0.65e-13■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 UXS1-208ENST00000457835 682 ntTSL 418.77■□□□□ 0.65e-13■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 NME4-208ENST00000454619 719 ntTSL 514.04□□□□□ -0.161e-11■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 TFR2-210ENST00000474947 1514 ntTSL 216.76■□□□□ 0.277e-13■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.077e-13■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 NUDT9-206ENST00000514227 566 ntTSL 414.96□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 41.1
DDX3XO00571 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-36■■■■■ 41
DDX3XO00571 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.022e-36■■■■■ 41
DDX3XO00571 CYB5A-207ENST00000583418 5913 ntTSL 29.7□□□□□ -0.862e-36■■■■■ 41
DDX3XO00571 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.212e-36■■■■■ 41
DDX3XO00571 TSKU-204ENST00000533752 643 ntTSL 416.31■□□□□ 0.22e-9■■■■■ 41
DDX3XO00571 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.341e-13■■■■■ 41
DDX3XO00571 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.171e-13■■■■■ 41
DDX3XO00571 ARF5-205ENST00000467281 567 ntTSL 419.73■□□□□ 0.753e-14■■■■■ 41
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