Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITPNM1O00562 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITPNM1O00562 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PITPNM1O00562 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITPNM1O00562 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms